同济大学嵌入式系统与服务计算教育部重点实验室

[存为首页] [加入收藏]  

欢迎访问同济大学嵌入式系统与服务计算教育部重点实验室

 公元2017年9月21日[星期四]

总访问量:279718    

■首 页 ■实验室概况 ■科研平台 ■研究方向 ■科研队伍 ■科研项目 ■科研成果 ■开放课题 ■人才培养 ■文件下载
当前位置:主页-学术活动-“智信讲坛”(第六十三)期学术报告

“智信讲坛”(第六十三)期学术报告

浏览次数:302

【保护视力背景色: 杏仁黄 秋叶褐 胭脂红 芥末绿 天蓝 雪青 灰 银河白(默认色)】 【字色: 绿 粉红 深蓝】 【字体:8 7 6 5 4 3 2 1


  题目:用经验贝叶斯模型从第三代测序数据定量检测DNA修饰
  
  报告人:张学工
  
  时间:5月25日10点
  
  地点:电信大楼403室
  
  邀请人:赵兴明 教授
  
  报告人简介:
  张学工,1989年毕业于清华大学自动化系,1994年于清华大学获模式识别与智能系统专业博士学位,现为清华大学自动化系教授、生命学院和医学院兼职教授,清华信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部主任,清华大学学术委员会委员,中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会主任、中国生物物理学会生物信息学与理论生物物理专业委员会副主任,是国家杰出青年基金获得者、国家级精品课程主讲人、国家973计划首席科学家,主要研究方向是模式识别与生物信息学。
  
  内容提要:
  The next-generation sequencing has become a major technology in current biology. Correctly and efficiently reading out the full biological information contained in the massive sequencing data is the foundation of all biological analyses, and is a major task for current bioinformatics. The third-generation single molecular real time (SMRT) sequencing technology not only provides an opportunity for obtaining very long reads, but the real-time nature of the sequencing reaction leaves signatures of DNA modifications in the obtained sequencing signals. We investigated the characteristics of these signals and developed a flexible hierarchical model for detecting DNA modifications from SMRT sequencing data. The application on bacteria genome sequencing data indicated the existence of epigenetic heterogeneity in a cell population, and we further developed an empirical Bayes mixture model to quantitatively estimate this heterogeneity of DNA modification. The method was validated on both simulation and bacteria DNA modification data.
  
  
  
  欢迎各位老师同学踊跃参加!
 

发布日期:2016-05-25

本篇已是该组第一篇   

本篇已是该组最后一篇